Eine Website kann gleichzeitig verschiedene WaBis-Wikis beherbergen. Jedes Wiki kann ein eigenes Thema enthalten. Ein anderes Wiki derselben Website wird als Nachbar-Wiki bezeichnet.
Alle Wikis einer Website sind in der Regel untereinander verknüpft. Das bedeutet, dass Seiten zwischen verschiedenen Wikis genau gleich miteinander verlinkt werden können wie Seiten innerhalb des selben Wikis.
Trotzdem bilded jedes Wiki eine abgeschlossene Einheit oder einen Bereich, der ein bestimmtes Thema umfassen kann. Bei der Suche werden die Fundstellen nach Wikis bzw. Bereichen geordnet.